- Docente responsabile
- MARCO DOMENICO SANTAMBROGIO
- CCS proponenti
- Ingegneria Informatica
- CFU
- 2
- Ore in presenza
- 12
- N° max studenti
- 100
- Parole chiave:
- Genomica, PANGENOME ANALYSIS, Pangenomica
- Tag
- Informatica, Ingegneria, Scienza, Salute e scienze della vita, Tecnologie dell'informazione
Descrizione dell'iniziativa
L'avvento delle tecnologie di sequenziamento di nuova generazione (NGS) ha permesso di ridurre notevolmente i tempi di digitalizzazione del materiale genetico, producendo un'esplosione della quantità di dati genomici generati. Questa disponibilità di dati di sequenziamento in rapida crescita è stata fondamentale per lo sviluppo di molte applicazioni, come la medicina personalizzata o la tecnologia del DNA ricombinante nell'industria alimentare e zootecnica. Tuttavia, sono necessarie soluzioni computazionali più efficaci per sfruttare correttamente questo enorme contenuto di informazioni. Per affrontare questa sfida, sono stati sfruttati diversi acceleratori hardware (come GPU e FPGA) per velocizzare più fasi della pipeline di analisi. Dall'altro lato, sono stati introdotti nuovi paradigmi computazionali, come le strutture a grafo, per aumentare l'accuratezza e la completezza della rappresentazione dei dati genomici. Insieme a questi, è stato introdotto un livello di complessità più elevato, che ha portato alla definizione di nuove sfide tecniche: lo sviluppo di strumenti computazionali per la gestione e l'analisi dei cosiddetti grafi genomici.Questo corso si propone di fornire conoscenze e competenze nell'ambito della genomica computazionale, partendo dalle basi dell'analisi del genoma e arrivando fino agli ultimi progressi nel campo. Tra gli argomenti trattati vi saranno gli algoritmi e i metodi per l'analisi lineare del genoma, l'integrazione delle ottimizzazioni hardware per aumentare il throughput, l'approccio alla genomica a grafo e alla pangenomica e le basi Graph Machine Learning applicato a questo campo.
Periodo di svolgimento
dal Aprile 2025 a Maggio 2025
Calendario
- 10 Aprile 2025, dalle 6pm alle 8pm
- 16 Aprile 2025, dalle 6pm alle 8pm
- 17 Aprile 2025, dalle 6pm alle 8pm
- 29 Aprile 2025, dalle 6pm alle 8pm
- 6 Maggio 2025, dalle 6pm alle 8pm
- 8 Maggio 2025, dalle 6pm alle 8pm